НУКЛЕОТИ́ДНЫЕ ПОСЛЕ́ДОВАТЕЛЬНОСТИ
-
Рубрика: Биология
-
Скопировать библиографическую ссылку:
НУКЛЕОТИ́ДНЫЕ ПОСЛЕ́ДОВАТЕЛЬНОСТИ, порядок следования нуклеотидных остатков в нуклеиновых кислотах. Н. п. ДНК записываются в виде последовательностей букв, обозначающих входящие в нуклеотиды азотистые основания: A – аденин, G – гуанин, C – цитозин, T – тимин, без пробелов, в направлении от 5′-конца к 3′-концу, напр. GATTC. В РНК вместо тимина присутствует урацил (U). Одна Н. п. комплементарна другой, если она содержит в каждом положении комплементарный нуклеотид (A к T, G к C) и читается в противоположном направлении. Напр., комплементарной последовательностью для GATTCC является последовательность GGAATC. В двунитевой молекуле ДНК Н. п. двух цепей являются комплементарными.
Помимо символов G, A, T и C, соответствующих одному из четырёх нуклеотидов, для записи Н. п. ДНК в случаях, когда точная последовательность неизвестна, несущественна или существуют её варианты, по рекомендации ИЮПАК используют символы, обозначающие неопределённость: R=G или A, Y=T или C, K=G или T, M=A или C, S=G или C, W=A или T, B=G или T или C, D=G или A или T, H=A или C или T, V=G или C или A, N= любой нуклеотид. Аналогично записываются Н. п. в РНК.
В биологич. системах Н. п. ДНК содержат информацию, используемую живой клеткой для синтеза определённых белков и РНК, для регуляции экспрессии генов. В частности, Н. п. определяет последовательность аминокислот в синтезируемом клеткой белке. Последовательность трёх оснований, называемая кодоном, соответствует одной аминокислоте, соответствие между возможными сочетаниями трёх оснований и кодируемой аминокислотой определяется генетическим кодом. Механизм передачи информации, содержащейся в Н. п., описывается центр. догмой молекулярной биологии: информация передаётся от нуклеиновых кислот к белку. ДНК транскрибируется по принципу комплементарности с образованием молекулы мРНК, которая служит матрицей для синтеза белка рибосомой. У РНК-содержащих вирусов информация об аминокислотной последовательности вирусных белков записана в Н. п. вирусной РНК.
Н. п. определяется с помощью секвенирования ДНК. Поскольку Н. п. ДНК живого организма кодирует всю необходимую для его жизни и размножения информацию, определение Н. п. является важной основой для изучения биологич. объекта (см. Геномика). Напр., в медицине оно может быть использовано для идентификации и диагностики изменений Н. п., определяющих генетич. болезни. Определённые с помощью секвенирования Н. п. хранятся в цифровом формате, в виде последовательностей букв. Эти последовательности могут быть помещены в базы данных Н. п., их можно анализировать методами биоинформатики и использовать в качестве матриц при создании ДНК с помощью химич. синтеза.