Катепси́ны (от греч. καθέψω – варить, переваривать), группа внутриклеточных протеолитических ферментов. Локализованы главным образом в лизосомах. Обладают широкой субстратной специфичностью. Различные катепсины обозначаются буквами латинского алфавита.

Участвуют в переваривании белков внутри клеток (расщепляют пептидные связи как внутри, так и на концах белковых молекул), лизируют захваченные в процессе фагоцитоза бактерии и чужеродные частицы. Некоторым катепсинам свойственно участие в процессинге различных белков, морфогенезе кожи и др.

Опухолевые клетки секретируют катепсины во внеклеточное пространство, что способствует процессам инвазии и метастазирования. Определение активности ряда катепсинов (например, B и D) используется в диагностике некоторых видов злокачественных опухолей.